Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms