Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms