Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tns3Q5SSZ5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tns3Q5SSZ5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tns3Q5SSZ5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tns3Q5SSZ5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tns3Q5SSZ5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tns3Q5SSZ5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms