Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms