Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms