Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms