Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms