Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms