Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg1lQ3V384 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg1lQ3V384 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms