Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elf3Q3UPW2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms