Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms