Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Parp3Q3ULW8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms