Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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