Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a5Q3U1J0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms