Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms