Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms