Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh5Q3TSG4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh5Q3TSG4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms