Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms