Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss1Q33DR2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss1Q33DR2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdss1Q33DR2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss1Q33DR2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdss1Q33DR2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss1Q33DR2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss1Q33DR2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms