Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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MKRN4PQ13434 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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MKRN4PQ13434 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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MKRN4PQ13434 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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