Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms