Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cnn1Q08091 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms