Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fmn1Q05860 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms