Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoc2Q05020 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms