Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Emx2Q04744 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms