Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms