Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms