Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms