Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms