Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nucb2P81117 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms