Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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