Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CiitaP79621 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms