Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms