Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap25P60879 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms