Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms