Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpaP58389 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpaP58389 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpaP58389 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms