Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms