Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms