Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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GdnfP48540 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GdnfP48540 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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