Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syt1P46096 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms