Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf5P43027 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms