Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rom1P32958 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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