Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms