Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms