Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja1P23242 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja1P23242 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja1P23242 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms