Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P20040 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P20040 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P20040 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P20040 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P20040 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P20040 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P20040 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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