Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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