Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scd1P13516 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scd1P13516 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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