Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms