Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms